pdf35

Ribogospod. nauka Ukr., 2013; 1(23): 80-86
DOI: https://doi.org/10.15407/fsu2013.01.080
УДК 597-12:576.85.08

ІДЕНТИФІКАЦІЯ ГРАМНЕГАТИВНИХ БАКТЕРІЙ У РИБ МЕТОДОМ ПЛР- ПДРФ ГЕНУ 16S рРНК

Ю. П. Рудь,  Ця електронна адреса захищена від спам-ботів. вам потрібно увімкнути JavaScript, щоб побачити її. , Інститут рибного господарства НААН, м. Київ

Розроблено комплексний метод полімеразної ланцюгової реакції та поліморфізму довжин рестрикційних фрагментів (ПЛР-ПДРФ) гену 16S рРНК для ідентифікації найпоширеніших грамнегативних (Г-) бактерій – збудників інфекційних захворювань риб. Показано специфічність та ефективність універсальних олігонуклеотидних праймерів для гену 16S рРНК (Г-) бактерій, а також можливість диференціації цих бактерій за допомогою набору ендонуклеаз рестрикції.

Ключові слова: ПЛР-ПДРФ, 16S рРНК, грамнегативні (Г-) бактерії.

ЛІТЕРАТУРА

1. Woo P.T.K., Bruno D.W. 2011. Fish Diseases and Disorders. Volume 3: Viral, Bacterial and Fungal Infections. CABI, 944 pp.
2. Cerro A. Simultaneous detection of Aeromonas salmonicida, Flavobacterium psychrophilum, and Yersinia ruckeri, three major fish pathogens, by Multiplex PCR / A. Cerro, I. Marquez, J. A. Guijarro // Appl. Environ. Microbiol. 2002. – Vol. 68, № 10. – P. 5177–5180. http://dx.doi.org/10.1128/AEM.68.10.5177-5180.2002
3. Wagner C. Molecular diagnostics // J. Mol. Med. – 1997. – Vol. 75. – P. 728-744. http://dx.doi.org/10.1007/s001090050159
4. Cunningam C.O. Molecular diagnosis of fish and shellfish disease: present status and potential use in disease control // Aquaculture. – 2002. – Vol. 206. – P. 19-55. http://dx.doi.org/10.1016/S0044-8486(01)00864-X
5. Мусселиус В.А., Ванятинский В.Ф., Вихман А.А. и др. // Лабораторный практикум по болезням риб. – М.: Легкая и пищевая пром-сть, 1983. – 296 с.
6. Sambrook J. Molecular cloning: a laboratory manual, 3rd ed / J. Sambrook, D.W. Russell. – New York: Cold Spring Harbour, 2001.
7. McPherson M.J. PCR. The basics: from background to bench / M.J. McPherson,
S.G. Moller. – New York: BIOS Scientific Publishers Ltd, 2000. – p. 276.
8. Altinok I. Molecular diagnosis of fish diseases: a review / I. Altinok, I. Kurt // Turkish Journal of Fisheries and Aquatic Sciences. – 2003. – Vol. 3. – P. 131-138.
9. Brasher C.W. Detection of microbial pathogens in shellfish with multiplex PCR / C.W. Brasher, A. DePaola, D.D. Jones, A.K. Bej // Curr. Microbiol. - 1998. – Vol. 37. – P. 101–107. http://dx.doi.org/10.1007/s002849900346
10. Chakroun C. Random amplified polymorphic DNA analysis provides rapid differentiation among isolates of the fish pathogen Flavobacterium psychrophila and Flavobacterium species / C. Chakroun, M.C. Urdaci, D. Faure et al. // Dis. Aquat. Org. – 1997. – Vol. 31. – P. 167-177. http://dx.doi.org/10.3354/dao031187
11. Hanninen M.L. Genetic deversity of atypical Aeromonas salmonicida studied by pulsed-field gel elecrophoresis / M.L. Hanninen, V. Hirvella-Koski // Epidemiol. Infect. – 1999. – Vol. 123. – P. 299-307. http://dx.doi.org/10.1017/S0950268899002903