Ribogospod. nauka Ukr., 2016; 4(38): 113-122
DOI: https://doi.org/10.15407/fsu2016.04.113
УДК: 575.15; 639.3.032

pdf35

Аналіз генетичної структури окремих типів українського лускатого коропа

А. Е. Маріуца, Ця електронна адреса захищена від спам-ботів. вам потрібно увімкнути JavaScript, щоб побачити її. , Інститут рибного господарства НААН, м. Київ
С. І. Тарасюк, Ця електронна адреса захищена від спам-ботів. вам потрібно увімкнути JavaScript, щоб побачити її. , Інститут рибного господарства НААН, м. Київ
І. І. Грициняк, Ця електронна адреса захищена від спам-ботів. вам потрібно увімкнути JavaScript, щоб побачити її. , Інститут рибного господарства НААН, м. Київ

Мета. Вивчення специфіки генетичної структури, рівня внутрішньо- та міжпопуляційної генетичної мінливості стад українського лускатого коропа різних господарств України за використання ДНК-маркерів (ISSR-PCR).

Методика. Для дослідження специфіки генетичної структури на підставі ПЛР використовували ІSSR-PCR-методику з відповідно підібраними праймерами.

Результати. На підставі виконаних досліджень за використання трьох мікросателітних локусів ДНК — (AGC)6G, (AСC)6G, (AGC)6С — проведено аналіз генетичної структури українських лускатих коропів. Сумарно за всіма праймерами виявлено 55 ампліконів. При використанні праймеру (AGC)6G виявлено 15, (AСC)6G — 17, (AGC)6С — 23 амплікони. Молекулярна маса на електрофореграмах була максимальною при використанні праймеру (AСC)6G (500 п.н.–3500 п.н. у нивківського коропа). Виявлені специфічні особливості між досліджуваними популяціями лускатих коропів залежать від їх генетичного походження. Варіацій виявлених ампліконів достатньо, щоб відокремлювати особин, або, якщо робота проводиться з групою плідників, підбирати батьківські пари для підвищення генетичного розмаїття.

Наукова новизна. За використання ISSR-маркерів встановлено особливості генетичної структури, рівень генетичної мінливості українських лускатих коропів.

Вперше отримано нові дані про специфіку генетичної структури за використання методів ПЛР, які сприяють виявленню специфіки механізмів підтримки відносної стабільності генофонду українського лускатого коропа і дозволяють контролювати та зберігати специфічність його генетичної структури.

Практична значимість. Запропоновано метод генетичного контролю стад, який дає можливість за використання вказаних праймерів провести аналіз генетичної структури племінних стад і реалізувати генетичну інформацію на різних стадіях селекційного процесу.

Ключові слова: ISSR-PCR, ДНК-маркери, український лускатий короп, генотип, амплікон.

ЛІТЕРАТУРА

  1. Wallace R. B. DNA recombinant technology / Wallace R. B. — Boca Raton (Fla.) : CRC press, 1983. — 212 p.
  2. Primer-directed enzymatic amplification of DNA with a thermostable DNA polymerase / R. K. Saiki, D. H. Gelfand, S. Stoffel [et al.] // Science. — 1988. — Vol. 239. — № 2. — Р. 487—491.
  3. ISSR-PCR маркеры и мобильные генетические элементы в геномах сельскохозяйственных видов млекопитающих / В. И. Глазко, Е. А. Гладырь, А. В. Феофилов [и др.] // Сельскохозяйственная биология. — 2013. — № 2. — С. 71—76.
  4. Schlotterer C. Evolutionary dynamics of microsatellite DNA / C. Schlotterer // Chromosoma. — 2000. — Vol. 109. — P. 365—371.
  5. Сулимова Г. И. ДНК-маркеры в генетических исследованиях: типы маркеров, их свойства и области применения / Г. И. Сулимова // Генетика. — 1995. — Т. 31, № 9. — С. 1294—1299.
  6. Comparative Analysis of Using Isozyme and ISSR-PCR Markers for Population Differentiation of Cyprinid Fish / O. N. Zhigileva, O. G. Baranova, V. V. Pozhidaev [et al.] // Turkish Journal of Fisheries and Aquatic Sciences. — 2013. — Vol. 13. — 159—168.
  7. Genetic diversity and structure of natural Dactylis glomerata L. populations revealed by morphological and microsatellite-based (SSR/ISSR) markers / P. Madesis, E. M. Abraham, A. Ι. Kalivas [et al.] // Genet. Mol. Res. — 2014. — Vol. 13(2). — Р. 4226—4240.
  8. Тарасюк С. І. Молекулярно-генетичні методи в рибництві : монографія / С. І. Тарасюк, І. І. Грициняк. — К. : Аграр. наука, 2013. — 312 с.
  9. Фермерське рибництво / [Грициняк І. І., Гринжевський М. В., Третяк О. М. та ін.]. — К. : Герб, 2008. — 560 с.
  10. Шерман І. М. Розведення і селекція риб / Шерман І. М., Гринжевський М. В., Грициняк І. І. — К. : БМТ, 1999. — 238 с.
  11. Rogstad S. Gelstat : a computer program for population genetics analyses using VNTR multilocus probe data / S. Rogstad, S. Pelisan // Bio Techniques. — 1996. — Vol. 21, № 6. — P. 187—196.
  12. Zietkiewicz E. Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR)-anchored polymerase chain reaction amplification / E. Zietkiewicz, A. Rafalski, D. Labuda // Genomics. — 1994. — Vol. 20, № 2. — P. 176—183.
  13. Nei M. Estimatiuon of average heterozygosity and genetic distance from a small number of individualus / M. Nei // Genetics. — 1978. — Vol. 89. — P. 583—590.